转录

转录终止(transcription termination)

知道何时停下,与知道何时开始同样重要——否则抄写员会一路写进下一道菜谱、再下一道,最终糊成一大团没用的乱涂。转录终止就是细胞的那个句号:让RNA聚合酶释放出造好的RNA、放开DNA、就此收手的信号与机制。

细菌主要用两种方式来停。一种是内在(或称不依赖因子)终止:新造的RNA含有一段会自我回折、形成稳定发夹环的序列,其后紧跟一串尿嘧啶;发夹使聚合酶失稳,而弱的U-A配对让RNA滑脱,合成随之结束。另一种是依赖Rho的终止:一种叫Rho的蛋白扣住RNA,沿转录本追赶聚合酶,像赶火车的人追上列车一般,最终在酶暂停时把RNA撬下来。真核生物的终止方式不同、也更松散:终止与RNA加工挂钩——对RNA聚合酶II而言,转录本中的一个切割信号触发剪切并加上一条多聚A尾,此后聚合酶最终在下游脱落。

终止界定了一条转录本的3'边界,确保每个基因产出一条长度恰当、彼此分立的RNA,而不是一条乱糟糟、读穿进相邻基因的长链。它还提供了又一个调控机会:在某些细菌中,终止是否提早发生(衰减)决定了一个基因究竟有多少被转录出来。把这个“停”做对,正是干净可用的信息与分子层面的胡言乱语之间的分野。

细菌的内在终止子看起来像一段富含GC、自身互补的序列(形成发夹),其后在最3'端紧跟着诸如……UUUUUU——发夹使聚合酶停顿,而弱的rU-dA配对则松开。

内在终止子:一个发夹后跟一串尿嘧啶,从而释放RNA。

在真核生物中,Pol II并没有一个干净利落的发夹停止符号;其终止较为草率,且与切割和多聚A加尾相偶联,因此聚合酶常常在成熟RNA真正的末端之后再前行几百个碱基才放开。

又称
termination of transcription转录终止阶段