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模板链与编码链(template versus coding strand)

DNA有两条缠绕在一起的链,但当一个基因被转录时,RNA聚合酶只读其中一条。那么读的是哪一条?又为什么最终的RNA看起来像那条从未被读过的链?本词条厘清这两条链各自扮演的两种角色。

在两条DNA链中,聚合酶真正读取的那条叫模板链(也叫反义链)。聚合酶造出与之互补的RNA,按A配U、G配C配对。但有意思的转折在于:因为碱基配对是对称的,造出来的RNA在序列上与另一条链——编码链(或称有义链)——完全一致,唯一的区别是RNA凡是DNA为T的地方都换成U。所以若编码链读作 5'-ATGCCT-3',RNA就读作 5'-AUGCCU-3',而被读取的模板链则是它的互补链 3'-TACGGA-5'。我们把基因序列写成编码链的形式,正是因为它“读起来像”RNA。哪条链充当模板,并非整条染色体一成不变——而是一个基因一个基因地决定,因为相邻的基因可能朝相反方向转录,各自使用方向合适的那条链。

把这些名称弄清楚,能化解一个经典的混淆来源。模板链是携带着被读取信息的那条,可我们谈密码子和遗传密码时引用的却是编码链的序列。日后你在数据库里看到某基因的“序列”、发现起始密码子ATG赫然在列时,你看到的正是编码链——聚合酶从未碰过它,它读的是它的镜像。

编码链:5'-A T G C C T A G-3'。模板链:3'-T A C G G A T C-5'。生成的RNA:5'-A U G C C U A G-3'。RNA等于编码链把T换成U。

RNA与编码链一致(T换U),并与它所读取的模板链互补。

“有义”和“反义”这两个标签容易颠倒直觉:反义(模板)链才是真正被使用的那条,而有义(编码)链只是恰好与RNA拼法相同。“有义”指的是与信息一致,而非指它被读取。

又称
template strandcoding strandantisense strandsense strand模板链编码链