错配修复（mismatch repair）

即便是再出色的校对型复印机也会出错，DNA聚合酶也不例外：它时不时会插入一个错误碱基、躲过自身的校对，留下一对错配，比如一个G对着一个T。错配修复就是紧跟在复制之后的清理小队，找出这些新鲜的错误并加以修正——把复制的整体准确度再提高约一百倍。

难点不在于发现错配，而在于判断两条链中哪一条错了。两个碱基都是完全正常的DNA字母；唯一能把带错的新链与正确的旧模板区分开的，是新链刚刚被合成出来。修复系统利用一种暂时的「新生」标记——在细菌中新链短时间内未被甲基化，在人类中该系统识别新合成链上尚未封闭的切口。一旦知道哪条是新链，系统就移除其中跨越错配的一段，再以可信赖的旧链为模板把这一段正确地重新合成。

错配修复也是细胞抵御重复序列中打滑的防线——在重复序列里聚合酶容易结巴、多加或漏掉一个单元，因此它的失效表现为不稳定、长度漂移的重复——这种印记被称为微卫星不稳定性。遗传到一个损坏的错配修复基因会导致林奇综合征，这是最常见的遗传性结直肠癌，生动地诠释了一条规律：无法纠正自身复制错误的细胞会迅速积累突变并滑向癌症。