先导优化与药物设计

亲脂性配体效率

亲脂性配体效率(LLE)提出一个诚实的问题:你的分子之所以结合,是因为它真正契合靶点,还是仅仅因为它够油?给钥匙抹上油,或许能让它滑进更多锁孔,但那并不是真正的契合。LLE 把高明的结合与廉价的、靠油性硬黏上去的结合区分开来。

它的算法非常简单:以对数尺度表示的活性(pIC50 或 pKi)减去 logP。高 LLE 意味着你用相对较低的亲脂性换来了大量结合,这是高质量、特异性相互作用的标志。低 LLE 则警示:表观活性中很大一部分来自油性,而这种结合往往会拖带溶解度差、乱结合和毒性。

药物化学家会在一个系列中追踪 LLE,以确保自己是在用正确的方式改进分子。一个仅因变得更亲脂而活性升高的化合物,LLE 并无提升,往往是个陷阱;真正可贵的类似物,是那些在维持或降低亲脂性的同时提高活性、从而抬升 LLE 的分子。

两个类似物的 IC50 都是 100 nM,但一个 logP 为 2、另一个为 5;logP 较低者 LLE 更高,通常是更好的起点。

活性相同,结合质量却大不相同。

常被引用的目标是:有吸引力的先导物 LLE 大致高于 5–7,但合适的数值取决于靶点类别。

又称
LLE亲脂效率親脂效率