基因组学与DNA测序
基因组注释
基因组注释是为一段未加标记的DNA序列添加标签的过程,把一串毫无意义的字母变成一张经过解读的地图。原始基因组就像一份没有任何标注的手稿;注释则标明基因从何处开始、到何处结束、有什么功能,以及调控特征位于何处。
注释在两个层面上进行。结构注释识别各种特征的位置——编码蛋白质的基因、外显子和内含子、RNA基因、启动子,以及重复序列。功能注释随后赋予其生物学含义,预测每个基因的产物有什么作用,常常是通过将它与其他生物中已知功能的基因相比较来完成。
注释是一种预测,而非确定的事实,并且会随时间不断改进。计算机算法依据序列模式以及与已知基因的相似性做出最佳猜测,但错误难免会渗入,尤其是对那些不寻常或研究尚少的生物。随着新的实验证据不断积累,注释会持续修订,因此一个基因组的标注最好被看作一种活的、可更新的资源。
另见