药物靶点与生物大分子

成药性

成药性是对一个靶点蛋白是否拥有适合类药分子抓握之处的判断。即便某靶点明确导致疾病,药物也只有在能与该蛋白紧密结合时才能起效,而这通常需要一个大小与形状恰当的口袋。成药性所问的是:这里是否有一个供小分子把持的把手?

成药性高的靶点往往具有一个深而封闭的口袋,表面兼有疏水与极性区域,让小分子得以嵌入并形成众多有利的接触。只有浅、平或缺乏特征表面的靶点则较难成药,有时被称为不可成药,因为分子几乎无处着力。计算工具和实验试图在化学工作开始之前就尽早估计成药性。

成药性并非一成不变的定论,而取决于所考虑的分子类型。一个抵抗传统小分子的蛋白,也许会向多肽、共价结合剂或只需短暂触碰表面的降解剂屈服。需诚实指出的是,成药性预测并不完美,一些长期被认为不可成药的靶点,最终被新的化学策略攻克。

KRAS蛋白因表面缺乏良好的口袋而被认为不可成药达数十年之久,直到化学家利用一个突变的半胱氨酸来锚定共价抑制剂。

随着新化学策略创造出新的结合方式,成药性也会随之改变。

成药性关心靶点能否被结合,靶点验证关心结合它是否有益。一个好的药物项目两者缺一不可。