配體效率

配體效率衡量分子憑其大小換得多少結合力，好比藥物的「油耗經濟性」。兩個化合物也許對靶點結合得一樣好，但如果其中一個只用了一半的原子，它就是更高效的結合者，通常也是更好的起點。

正式定義是結合自由能除以重原子（非氫原子）的數目，因此它獎勵「以小博大」的小分子。一個雖強效卻被許多對結合貢獻甚微的額外原子撐大的化合物得分很低，而一個只形成幾處出色接觸的微小片段卻可能得分很高。這正是基於片段的發現如此倚重這一指標的原因。

追蹤配體效率而不只看原始活性，能幫助專案只在「物有所值」之處添加原子，避免滑向過大、油性過強的分子。相關指標如親脂配體效率還把親脂性納入考量，因為單純靠把分子做得更油來廉價換取的活性，往往是得不償失的假帳。