平衡選擇

大多數選擇最終都會推舉出單一的獲勝等位基因。平衡選擇則反其道而行：它主動地把兩個或更多個等位基因保留下來，就像一位裁判出面阻止任何一方獨佔整個棋盤。其結果是一種由選擇所維持、而非被抹去的多型性。

正式地說，平衡選擇是指任何一種能在長時段內把某個基因座上的多個等位基因維持在族群中、使其頻率保持穩定平衡而不把某一個推向固定的選擇方式。它是遺傳變異得以保存、而非被穩步喪失的一個關鍵原因。

產生它的機制有好幾種。在雜合子優勢（超顯性）中，雜合子比任一純合子都更適應，於是兩個等位基因都得以存留。在頻率依賴性選擇中，某個等位基因越稀有，其優勢就越大，於是它從不會徹底消失。在空間或時間上變化的選擇，同樣可以讓不同的等位基因繼續存在。

教科書式的例子是鐮狀細胞等位基因：攜帶一份拷貝可抵禦瘧疾，而兩份拷貝則致病，因此在瘧疾流行地區，選擇把該等位基因維持在一個中間頻率上，而非將其清除——這是一個以平衡、而非消除作為穩定結局的例子。