蛋白质结构与功能

二十种标准氨基酸

在可以想象的数百万种化学结构中,生命几乎全部的蛋白质都由一套固定的、仅二十个的氨基酸字母表搭建而成。把它们想成可用来书写蛋白质语言中每一个词、每一句话、每一本书的二十个字母。它们串联的顺序,拼写出一个蛋白质的身份。

这二十种共用同一副骨架,却在侧链上截然不同。有的侧链很小(甘氨酸只有一个氢;丙氨酸只多一个碳);有的是庞大的环(色氨酸);有的带正电或负电(赖氨酸、谷氨酸);有的像油脂、怕水(亮氨酸、缬氨酸);有的能形成特殊连接(含硫的半胱氨酸)。每一种都写成三字母缩写或单字母——甘氨酸是 Gly 或 G,色氨酸是 Trp 或 W——这些代号是分子生物学的常用速记。DNA 里的遗传密码以三碱基为一个词来读取,每个词指定这二十种中的一种。

为什么恰好是二十种?这部分是早期演化留下的“冻结的偶然”,部分是一个甜蜜的平衡点:种类足够多,才能搭出精巧能干的机器;又足够少,细胞才能可靠地制造并识别每一种。一个有用的诚实说明:“二十”是标准集合,但生命会变通——硒代半胱氨酸和吡咯赖氨酸是少见的第 21、第 22 种由遗传密码编码的氨基酸,而更多种类则来自蛋白质合成之后的化学修饰。

拼出人体内分解酒精的酶的,是这二十个字母;拼出蜘蛛吐出的丝的,也是同样这二十个字母。同一套字母表的不同排序,造就了千差万别的分子机器。

一套固定的二十字母表,以不同的顺序,写出了自然界中的每一个蛋白质。

二十是经典集合,而非绝对上限:硒代半胱氨酸和吡咯赖氨酸在某些生物中确实是被编码的额外成员,另有数十种氨基酸只作为后续修饰出现。

又称
the proteinogenic amino acids标准氨基酸標準胺基酸