分子量

分子量就是一个分子有多重，由其所有原子的质量相加得到，以道尔顿或克每摩尔表示。它是药物设计中最基本的尺寸标尺：粗略地说，数字越大，分子就越大、越笨重。

尺寸之所以重要，是因为较大的分子往往穿膜更慢、更难溶解、口服吸收更困难。小分子药物的分子量通常在约 500 道尔顿以下，这正是利平斯基五规则确立的阈值，尽管许多成功的口服药物会略高于此。

在优化过程中分子量往往会悄悄上涨，因为加原子是提升活性的便捷手段。关注它（以及相关的重原子数）能避免项目滑向"分子肥胖"——即以牺牲溶解度、膜透过性和整体成药性为代价，靠额外的体积换取活性。