扩增、测序与核酸分析

分子探针(molecular probe)

假设你有一大堆草垛般的DNA,想弄清其中是否藏着某一根针——某条特定序列。分子生物学里通用的诀窍是:造一段与之匹配的DNA,给它贴上标记好让你能看见,再让它只粘到自己的匹配对象上,从而找到那根针。这段带标记的匹配片段就是分子探针。

探针是一条单链DNA或RNA,其序列与你想检测的目标互补,并带有一个使它可被检测的标记——荧光染料、放射性原子,或一种能产生颜色的酶。其原理是碱基配对的特异性:在合适条件下,探针只会与匹配它的序列杂交(靠A-T和G-C配对粘上去),而不会粘到在场的其余数百万条序列上。于是你把带标记的探针与样品混合,让它结合目标,洗掉一切没粘住的东西,再去寻找标记。标记出现的地方,就是目标序列存在的地方。

探针是基于杂交的检测的主力:正是它让DNA印迹(Southern)或RNA印迹(Northern)、DNA微阵列上的点、以及FISH实验得以运作——每一种里都是一个带标记的探针报告某一选定序列的存在与量(有时还有位置)。诚实的局限就内置在这个概念里:探针永远只能检测它被设计去匹配的那条特定序列。它是一个你必须事先懂得怎么问的问题——极其特异,却对任何你没料到的东西视而不见。

要检测某个细菌样品是否携带某一特定的毒素基因,你设计一个与该基因互补的探针,给它标上染料,让它与样品DNA杂交。出现发光信号意味着该基因存在;没有信号则表示不存在。

带标记的互补链只粘到与它匹配的序列上。

探针只能检测它被设计去匹配的那一条序列——它极其特异,却无法发现任何你未曾预料的东西,所以基于探针的方法回答的是预先选定的问题,而非普查未知。

又称
nucleic acid probeDNA probehybridization probe核酸探针雜交探針