复制叉与复制泡（replication fork and bubble）

想象从拉链中间某一点把它拉开。随着你向两个方向拉，张开的缺口越来越大，在缺口的每一端都有一个Y形交界处，那里“仍闭合”遇上“已张开”。在复制中的DNA里，这个张开的缺口就是复制泡，而每个Y形交界处就是复制叉。复制叉正是实际进行复制的地方。

一旦DNA在起点处被撬开，两个复制叉便彼此分离地移动（双向复制），各自沿DNA前进并一边走一边解旋。在每个复制叉处，亲本双螺旋裂成两条单链，复制机器就坐在交界处，读取每条分开的链并铺设新的配对链。随着复制叉推进，它们之间的复制泡不断变大；在显微镜下，小的复制泡看起来像DNA上一只张开的眼睛，因此有时被称为复制眼。

复制叉是复制忙碌的工地：你会在那里看到负责解链的解旋酶、防止解开的单链重新黏合的单链结合蛋白、合成新链的引物酶和聚合酶，以及在前方工作以缓解扭曲张力的拓扑异构酶。在环状的细菌染色体里，来自oriC的两个复制叉绕行一周并在终止区相遇；在真核生物中，相邻起点产生的复制叉彼此相遇并融合，直到整条染色体复制完成。