诱导契合

结合口袋不是一个刚性冲压出来的孔；它更像一只柔软的手套，当你把手伸进去时会重新塑形。诱导契合描述的是蛋白靶点在配体结合时如何调整其构象——侧链让到一旁、环区合拢、螺旋移位——使得最终的贴合比空口袋本身所能允许的更紧密。锁改变了形状去握住钥匙。

从机制上看，诱导契合通常意味着配体先以某种形状与蛋白接触，由此产生的相互作用支付并稳定了靶点的构象变化。一个著名的例子是激酶的激活环和“DFG”基序，它们能在不同构象间翻转，让抑制剂触及在单一静态结构中看不见的口袋。

诱导契合之所以重要，是因为它既带来机会又增加了预测的难度。新出现的隐蔽口袋或“诱导”口袋可能提供新的选择性，但柔性靶点难以建模：针对单一刚性快照对接，可能漏掉那些只有在蛋白运动之后才贴合的结合物。它还有能量代价——蛋白必须放弃有利接触或自身产生张力来重排，而配体结合必须超过这一代价。