真核生物的基因调控与表观遗传学

转录激活域(transcriptional activation domain)

如果说DNA结合域是转录因子上那块知道该站在哪里的部分,那么激活域就是那块站定之后挥着手臂大喊“在这儿——快来抄这个基因!”的部分。它是那只伸出去、把转录的重型机器招募到这一点上的干活的手。

具体地说,激活域是转录因子上另一块分开的区域:当结合域把蛋白质锚定在它的DNA位点上时,激活域去接触其它蛋白质——中介体复合物、通用转录机器的组成部件、以及那些松开DNA包装的染色质修饰酶。靠着触碰它们、把它们拽到基因的启动子上,激活域提高了RNA聚合酶起步的概率以及起步的频率。耐人寻味的是,许多激活域单独存在时并没有固定的形状——它们是松软、低复杂度的片段,只有抓住伙伴时才折叠起来,而且往往你拥有得越多它们就越管用(几个弱激活域叠在一起胜过一个强的)。这种松散是个优点:它让一个激活域能跟许多不同的伙伴做出黏黏的、短暂的接触。

结合与激活的分工,是基因调控最深层的设计原理之一。因为两个域在物理上可以分开,一个激活域接到任何一块DNA结合部件上,就会激活那块部件所指向的任何基因——这是用来探测蛋白质伙伴的双杂交实验的基础,也是在果蝇和酵母遗传学里通用的、基于GAL4的工具的基础。它也把抑制因子解释为镜像:一个抑制域,在附近结合的蛋白质上,招募的是关闭基因的机器。动词住在激活域(或抑制域)里;地址住在结合域里。

研究者把酵母GAL4的激活域接到他们正在研究的某个蛋白质上;如果那个蛋白质遇到一个带着GAL4结合域的伙伴,这两半就在一个报告基因上方重新合体并把它开启——这就是探测蛋白质相互作用的经典酵母双杂交筛选。

转录因子的动词:一块招募机器的部分,与寻找基因的部分相互独立。

许多激活域本质上是无序的——在结合伙伴之前它们没有稳定结构。这很正常,甚至有用,并非缺陷;干真正的生物学活计并不要求有结构化的“折叠”。

又称
activation domaintransactivation domain激活结构域