鹼基編輯（base editing）

標準CRISPR的工作方式是把DNA弄斷、再讓細胞修復——但斷裂混亂、修復難料，而精確編輯的途徑又效率低下。鹼基編輯的發明是為了做一件更溫和的事：在原位以化學方式改動單個DNA字母，根本不切斷兩條鏈。如果說標準CRISPR是一把剪刀，鹼基編輯器更像一支化學鉛筆加橡皮，直接改寫一個字母。

鹼基編輯器是一種巧妙的融合體。它起步於一個殘廢的Cas9——它仍能被嚮導RNA引到目標、仍能撐開DNA，但已被失能、無法切斷兩條鏈。繫在它身上的是一種以化學方式改變某個鹼基的酶。胞嘧啶鹼基編輯器把一個C變成細胞讀取並複製為T的形式（於是C-G對變成T-A對）；腺嘌呤鹼基編輯器把一個A改成最終被讀作G的形式（A-T對變成G-C對）。被引到目標後，編輯器暴露出一小段單鏈DNA窗口，附著的酶把目標字母化學轉換，隨後細胞正常的複製就把這個改變固定下來——無需任何雙鏈斷裂。

鹼基編輯之所以重要，是因為人類致病突變中很大一部分是單字母改變，恰是鹼基編輯器能糾正的那類，而且它糾正得比「斷裂—修復」乾淨得多：更少的隨機插入和缺失，更小的發生大段非意願重排的機會。誠實的限制是：鹼基編輯器只能做某些轉換（常見的是C到T、A到G及其對應鹼基對），並不能做出所有可能的改變；它會作用於其小編輯窗口內任何匹配的鹼基（故附近某個非預期鹼基也可能被改動）；而且與所有CRISPR工具一樣，它也可能有脫靶活性。先導編輯的開發，部分正是為了突破這些限制。