近親交配

親屬共享祖先，因而也共享等位基因。當親屬彼此交配時，其後代更有可能從家族兩側各得到同一個祖先等位基因的一份拷貝。近親交配就是遺傳上有親緣關係的個體之間的交配，其核心的遺傳後果是純合性的增加。

正式地說，近親交配提高了一個個體在某基因座上所攜帶的兩個等位基因因共同遺傳而相同的幾率——即來自共同祖先的同一個等位基因的兩份拷貝。這使基因型頻率朝純合子偏移、遠離雜合子，即便等位基因頻率本身並未改變。其程度由近交係數來概括。

由於許多有害等位基因是隱性的、藏身於雜合攜帶者之中，純合性的增多便意味著這類等位基因更常被表達出來。由此導致的存活或生育力下降稱為近交衰退，對於小型、隔離或圈養的族群而言，這是一個嚴重的隱憂。

不過，近親交配本身並非一定是「壞事」。植物和動物育種者利用受控的近親交配來固定理想性狀、創造一致的品系，有些物種也慣常近親交配。風險之所以上升，恰恰是當稀有的有害隱性等位基因因純合而被揭示出來之時。