基因型頻率

如果說等位基因頻率數的是一張張單牌，那麼基因型頻率數的就是一手手牌。每個二倍體個體在某基因座上攜帶兩個等位基因，組成諸如AA、Aa或aa這樣的配對。基因型頻率就是族群中持有每種特定配對的比例。

它是族群中具有某一指定基因型的個體所佔的比例。對於具有A和a兩個等位基因的基因座，AA、Aa和aa這三種基因型的頻率之和必定為一，因為每個個體都必屬於其中之一。

基因型頻率與等位基因頻率彼此關聯，卻並不相同。從基因型頻率出發，你總能透過數拷貝數還原出等位基因頻率。反過來，要從等位基因頻率推算基因型頻率，則需要對等位基因如何配對作出假設，而這正是哈迪-溫伯格原理所提供的。

把觀察到的基因型頻率與隨機交配下的預期頻率相比較，是一項標準的初步檢驗：兩者不符就暗示著近交、選擇、族群結構或其他有趣的作用力正在起作用。