基因組編輯與 CRISPR

CRISPR 篩選

CRISPR 篩選一次向成千上萬個基因提出同一個問題:「如果把你關掉,會有什麼變化?」科學家不是編輯一個基因再觀察結果,而是在龐大細胞群中給每個細胞編輯一個不同的基因,再看哪些編輯讓細胞生長、死亡或表現不同。

在典型的混合篩選中,會遞送一個嚮導 RNA 文庫——常常對基因組中每個基因都設計一條或多條嚮導——使每個細胞只接收一條嚮導,從而剔除(或激活、或抑制)單個基因。隨後把這些細胞置於選定的壓力下,例如某種藥物。透過在起始和結束時測序嚮導 RNA,統計哪些被富集或耗減,研究者便可推斷哪些基因有助於或妨礙了存活。

篩選把遺傳學變成一種大規模、系統化的搜尋,已揭示出藥物靶點、必需基因和耐藥機制。它誠實的侷限包括:編輯不完全或脫靶、各條嚮導效率參差不齊,以及需要謹慎的統計學——一個命中只是有待驗證的假說,還不是已被證實的答案。

又稱
pooled CRISPR screenCRISPR 文库筛选CRISPR 文庫篩選