CpG島

在基因組的大部分區域，DNA字母C後面緊跟G的情形出奇地少見。CpG島則是一段較短的區域，其中這種CG配對異常密集，就像在原本稀疏的文本中出現的一座標點密集的小島。這些島嶼常常正好位於基因的起始處。

名稱中用小寫的p來標示沿一條鏈把胞嘧啶與鳥嘌呤連接起來的磷酸基，以區別於雙螺旋兩條鏈上C與G的配對。這些島嶼通常長幾百到幾千個鹼基，常見於人類相當大一部分基因的啟動子附近。

CpG島的特別之處在於它們的甲基化狀態。在健康細胞中，活躍基因處的島嶼通常保持不被甲基化，使基因可供轉錄。一旦某個島嶼被甲基化，相關基因往往就被關閉，而這種沉默可被子代細胞繼承。

CpG島的異常甲基化是許多癌症的標誌，那裡抑癌基因處的島嶼可能被錯誤地沉默。因此，無論在基礎研究還是在開發診斷標誌物的工作中，它們都受到密切關注。