自體免疫性內分泌疾病

免疫系統本應攻擊入侵者，而放過身體自己的組織。在自體免疫性內分泌疾病中，這種辨識失靈了，免疫系統把一個產生激素的腺體當作外來物來攻擊。這是誤傷，目標對準了一個內分泌器官，結果取決於這種攻擊對腺體做了什麼。

有時攻擊會摧毀腺體，造成激素缺乏：第1型糖尿病就是這樣抹去了產生胰島素的β細胞，橋本甲狀腺炎就是這樣逐漸消滅了甲狀腺組織，自體免疫性艾迪生病就是這樣毀掉了腎上腺皮質。另一些時候，免疫攻擊並不摧毀組織，而是模仿激素訊號：在格雷夫斯病中，抗體結合TSH受體並把甲狀腺開啟，反而造成激素過多。因此，同一種針對自身的過程，既可能導致激素過少，也可能導致激素過多。

這些疾病往往有家族聚集性，並傾向於成簇出現，因為共有的自體免疫遺傳傾向會影響不止一個腺體。醫師常透過查到特異性自體抗體——免疫系統針對腺體成分製造的蛋白——來發現它們，時間上常遠早於或伴隨著腺體的衰竭。治療通常處理由此產生的激素問題（補充缺失的或阻斷過多的），而非治癒背後的免疫攻擊。