扩增、测序与核酸分析
逆转录PCR(reverse-transcription PCR)
/ RT-PCR /
PCR复制的是DNA,但我们想测量的很多东西是RNA——细胞在某个基因被开启时制造的信使分子,或某种RNA病毒的基因组。你不能把RNA直接放进普通PCR。诀窍是先把RNA转成DNA,再扩增这段DNA。这种两段式的方法就是逆转录PCR。
第一段用一种叫逆转录酶的酶,它读取RNA模板、写出一条互补的DNA链(称为cDNA)——方向与通常的DNA到RNA相反,名字正由此而来。一旦RNA被复制成cDNA,普通PCR就接手,像对待任何DNA一样用引物和Taq扩增这段cDNA。所以RT-PCR其实是两种酶按顺序工作:先用逆转录酶做出DNA拷贝,再用DNA聚合酶把它扩增。
RT-PCR在现代生物学和医学中无处不在。它是检测RNA病毒的方法——针对新冠病毒的“PCR检测”其实就是先做逆转录、再做(定量)PCR。它也是检查某个特定基因是否在表达的方法,因为活跃的基因会产生mRNA。一个重要的易混点:“RT-PCR”(逆转录PCR,用于RNA)和“real-time PCR”(定量PCR,边反应边观察产物生成)是两个不同的概念,常被合在一起使用——而且这两个缩写长得很像,总让人搞混。
针对RNA病毒的临床“PCR检测”先用逆转录酶把拭子里的病毒RNA复制成cDNA,再扩增这段cDNA。没有病毒RNA就没有cDNA,也就没有扩增,结果为阴性。
RNA先被复制成cDNA,再由普通PCR扩增。
逆转录并不违反中心法则——克里克的规则从未禁止RNA到DNA,它禁止的是信息从蛋白质流回核酸。另外要当心:“RT-PCR”(逆转录)和“real-time PCR”(定量)是两回事,却常被合用。
又称
另见