核苷酸切除修复（nucleotide excision repair）

有些DNA损伤对单字母小修匠来说太大、太扭曲：笨重的化学加合物、紫外线造成的使螺旋扭结的胸腺嘧啶二聚体，以及其他使双螺旋形状变形的损伤。核苷酸切除修复正是为这类笨重、使螺旋变形的损伤而设的途径。碱基切除修复擦掉一个字母，核苷酸切除修复则切掉一整个短语。

它的逻辑是识别变形本身，而非损伤的具体化学性质，这使一条途径就能处理种类繁多的笨重损伤。蛋白质探测到螺旋上的扭结；随后在受损链上、损伤两侧各切一刀，释放出一段短的单链片段——在人类中约二三十个核苷酸长——把损伤一并带走。接着修复聚合酶以完好的对侧链为模板填补由此产生的缺口，连接酶封住最后的切口。笨重的损伤连同其周围的一小段一起被切除，并以一份干净的拷贝取而代之。

核苷酸切除修复正是保护我们抵御阳光的机制：它是人类细胞清除紫外诱发的胸腺嘧啶二聚体的主要途径。着色性干皮病把它的重要性暴露无遗，这种病由该途径的遗传缺陷引起，患者因阳光造成的二聚体始终无法清除，而遭受极度光敏感、严重皮肤损害以及高达千倍的皮肤癌风险。细菌用UvrABC蛋白运行着一个平行的版本，显示出这套修复逻辑何其古老而essential。