基因组学与DNA测序
新一代测序
新一代测序使读取基因组变得既快速又廉价。较老的桑格法一次只读取一个片段,而新一代测序在一次运行中并排读取数百万个片段——就像一次性拍下整座体育场的人群,而不是逐个采访每个人。
DNA被切成许多短片段,每个片段附着到载体表面并扩增成一个微小的簇,仪器随后同时读取所有这些簇,在每个循环中记录每个片段的一个碱基。由于如此众多的反应并行进行,每个碱基的成本急剧下降,曾经需要数年才能测定的人类基因组,如今一天即可完成。
代价在于读长和数据管理。大多数新一代测序读段都很短——通常几百个碱基——因此在长而重复的区域中把它们重新拼接起来可能很困难,而海量数据也对计算能力提出了很高要求。这些短读长平台如今主导着科研和临床基因组学,并日益由能够跨越短读段难以应对区域的长读长技术加以补充。
新一代测序有时也被称为高通量测序或大规模平行测序;这三个名称指向同一核心理念——同时读取海量的片段。
又称
另见