生物大分子的化学
官能团(functional group)
一辆车大部分是惰性的钢材和玻璃,但少数几个部件——油门、方向盘、刹车——才是发生动作的地方。分子也是如此:一个生物分子的大部分是不活泼的碳氢骨架,而少数几簇特别的原子,几乎承担了全部的化学。这些簇就是官能团。
官能团是一小群特定排布的原子,它赋予所附着的分子一种特征性的行为——而且无论它出现在哪里,行为都大致相同。分子生物学家经常碰到的有:羟基(-OH),它有极性、能形成氢键;羰基(一个碳与氧双键相连),活泼、见于糖类;羧基(-COOH),一种酸,会交出一个 H+ 而带负电;氨基(-NH2),一种碱,会抓住一个 H+ 而带正电;磷酸基(一个磷连着若干氧),带负电,是能量与 DNA 骨架的核心;以及巯基(-SH),它能把两个自己连成一根共价的二硫键。知道一个分子的官能团,就知道了它的电荷、它的溶解性,以及它能参与哪些反应。
官能团是分子生物学家解读一个分子所用的字母表。同一副碳骨架,取决于挂上哪些基团,可以变成一种酸、一种碱、一种糖、或一种能量载体。它们解释了为什么带羧基的分子是酸性的、为什么磷酸使 DNA 带负电、为什么氨基酸同时带正端和负端、以及一个反应会抓住哪些原子。认出这些基团,你在还不了解一个分子的其他任何信息之前,就能大致预测它长什么样、如何溶解、如何反应。
一个氨基酸一侧带着羧基(-COOH,酸性),另一侧带着氨基(-NH2,碱性);在体内 pH 下羧基带负电、氨基带正电,这就是为什么每个氨基酸都是一个两端带电的小分子。
少数几簇原子,承担了几乎全部的化学。
官能团的行为相当一致,但并非绝对——它确切的反应活性会被分子其余部分所影响,所以处于不同环境中的两个羟基,未必表现得一模一样。
又称
另见