全基因组CRISPR筛选（genome-wide CRISPR screen）

敲除一个基因，告诉你的是关于一个基因的事。但真正的问题往往是开放式的：在全部约两万个人类基因中，哪些是癌细胞挺过一种药物、或一种病毒完成感染、或你所关心的任何过程所必需的？全基因组CRISPR筛选的回答方式，是同时对每一个基因做实验，再让结果指向那些重要的基因。

诀窍是这样的。你构建一个庞大的向导RNA文库——合起来靶向基因组中的每一个基因，每个基因配几条向导。你以低剂量把这个文库送入一大群细胞，使每个细胞通常只接收一条向导、因而只敲除一个基因；这群细胞成了数百万个，各自缺失一个不同的单一基因。然后你施加一种选择或压力——加入药物、病毒，或你正在研究的任何东西——让它对细胞进行筛选。事后你给存活（或消失）的细胞测序，读出它们携带哪些向导RNA。变得富集的向导，标记出那些丧失后有助于存活的基因；掉队消失的向导，标记出那些必需的基因。向导RNA兼作一个内置条形码，告诉你每个细胞丢失了哪个基因。

这是现代功能基因组学中最有力的方法之一，把一项曾需数年的搜寻，变成一次合并进行的实验，它已揭示出药物靶点、必需基因，以及无数细胞过程背后的机器。其变体用CRISPR干扰或激活替代敲除，从而在全基因组范围内把基因调低或调高。诚实的告诫是：筛选找到的是关联，之后必须逐个基因加以验证；不同向导的有效程度参差不齐；脱靶效应和不彻底的敲除会增添噪声；而且一次筛选告诉你的是哪些基因对你测试的那个条件要紧，而非每个基因功能的全貌。