分子识别与结合作用力
盐桥
盐桥是一种“两全其美”的带电接触:它把离子吸引和氢键合二为一。设想药物上一个带正电的胺紧贴蛋白上一个带负电的羧酸根——它们因电荷而相吸,同时胺的 N–H 正对着羧酸根的氧形成氢键。结果是一个紧密且高度有方向性的锚点。
由于结合了两种有利的相互作用,一个被埋藏的盐桥能强力贡献亲和力和专一性,常常是固定配体在口袋中取向的关键“别针”。常见的搭档一边是质子化的碱性基团(胺、胍基),另一边是羧酸根、磷酸根或磺酸根。
需要老实指出的是,在水中形成盐桥的代价不小。每个搭档都必须先脱去紧紧束缚的水壳和反离子,这要消耗能量,因此净收益可能小于单纯静电所暗示的——尤其是当盐桥暴露于溶剂而非被埋藏时。当它深深地被蛋白屏蔽于水之外时收益最大。
许多靶向天冬氨酸蛋白酶或 GPCR 的药物,会在药物上的质子化胺与保守的天冬氨酸或谷氨酸之间形成盐桥,从而确定配体在口袋中的取向。
指向保守酸性残基的定向盐桥。
另见