蛋白质结构与功能
锁钥模型与诱导契合
酶是如何从细胞那拥挤的“汤”里恰好抓住对的分子,并把它握得稳稳当当来做化学的?人们提出过两种图景,而它们之间的对比,能告诉你许多关于蛋白质真实行为的事。
较早的图景是锁钥模型,由埃米尔·费舍尔(Emil Fischer)于 1894 年提出。它说酶的活性位点是一个刚性的形状,而底物是一把恰好与之相配的钥匙;只有对的钥匙才能插进那把锁,这干净利落地解释了专一性。较新、更准确的图景是诱导契合,由丹尼尔·科什兰(Daniel Koshland)于 1958 年提出。它说活性位点并非刚性,而是有些柔性:当对的底物靠近时,酶实际上会改变形状,环抱住底物,就像手掌包住一个球,或手套随着手滑入而塑形。结合与形状改变是一同发生的。这种紧密的合拢不仅握住底物,还帮助把催化侧链对齐,并把底物拉向它的过渡态。
这一区别为什么重要?锁钥模型是一幅不错的初步速写,作为专一性的简便说法至今仍有用,但诱导契合更贴近现实,能解释锁钥所不能解释的事:为什么有些酶只有在底物到来后才变得有活性,以及在一处的结合如何能重塑另一处。在你自己的思考里要对此诚实:刚性钥匙的模型是一种近似;真实的蛋白质是柔性的、会“呼吸”的机器,而这种柔性正是它们工作方式的一部分。
己糖激酶是给葡萄糖打上磷酸标记的酶,它会明显地环抱住葡萄糖、合拢闭口,就像吃豆人合上嘴巴——这是诱导契合的教科书画面,刚性的锁钥模型永远捕捉不到。
真实的酶常会环抱住底物——这是刚性锁钥图景所忽略的柔性。
锁钥是较简单、较早的模型;诱导契合是较准确的模型。锁钥与其说“错”,不如说不完整——它忽略了蛋白质真实的柔性。
又称
另见