活性位点

酶是一种能加速化学反应的蛋白质，但它并不在整个表面上发挥作用。真正的工作发生在一个小小的、特别的地方——折叠蛋白质上的一个口袋或裂隙，反应的原料在那里被握住并被改造。那个干活的口袋，就是活性位点。

活性位点通常是蛋白质表面的一处凹腔，由几个特定的侧链衬里。那里进行两件事。第一是结合：酶所作用的分子，叫做底物，滑入口袋，被一张弱相互作用之网握住——氢键、电荷吸引、疏水接触——这张网像量身定制的手套一样贴合底物的形状与化学性质。第二是催化：底物一旦被恰到好处地握住，衬在口袋里的侧链便对它做化学——推挤电子、给出或抢夺质子、把某个键拉向断裂——将它变成产物，产物随后离开。衬在活性位点里的侧链往往在序列上相距甚远，只因折叠才被聚到一起，这正是为什么三维形状就是一切。

活性位点的两个特点，解释了酶的大部分行为。它的形状与化学性质赋予酶以专一性——为什么某个酶作用于某一种底物而无视其他。而它催化侧链的排布，则通过稳定反应必须经过的那个别扭的中间态，使反应得以加快。正因为这么多东西都系于这个小口袋，一个改变某个活性位点残基的单点突变，就可能彻底废掉一个酶，哪怕这个庞大蛋白质的其余部分完好无损。