分數座標（fractional coordinates）

原子在單位晶胞裡的哪個位置？晶體學家不是用公尺來報座標，而是用「沿每一條晶胞邊走了幾分之幾」來表示。正中央的點是 (1/2, 1/2, 1/2)；角落是 (0,0,0)；只沿 a 邊走到一半是 (1/2, 0, 0)。就像說「橫著走到一半、往上走三分之一」，跟這塊磁磚實際多大無關。

一個位置寫成 r = x a + y b + z c，其中 x、y、z 各介於 0 和 1 之間（超出這範圍只是跑到相鄰晶胞去）。因為它們是晶胞邊長的分數，所以不管用什麼單位、同一組座標都描述同一顆原子，而且即使坐標軸不互相垂直，它們也會自動符合晶胞的形狀。例如鑽石的兩顆碳原子坐落在 (0,0,0) 和 (1/4,1/4,1/4)。

完整的晶體結構，只要用晶格參數加上基元中各原子的分數座標（也就是不對稱單位）就能精簡地指定，其餘的原子再由對稱操作生成。要把分數座標換算成真實距離，得用到晶胞參數——例如在 a = 4 埃 的晶胞中，x = 1/4 的原子沿 a 距原點 1 埃。