表位/亲和标签（epitope / affinity tag）

想象给一件物品缝上一个独特的小把手，这样你就能在人群中随时抓住它或认出它。在蛋白工作中，生物学家正是这么做：他们用基因手段在蛋白上加一段短的、标准化的序列，从而有一种可靠的办法去检测它，或把它从混乱的混合物里拽出来。这个附加物叫标签，而蛋白加标签就构成融合蛋白。

标签有两种相互交叠的类型，都是通过把编码标签的额外DNA融合到你的基因上来附加，使蛋白在合成时就自带标签。表位标签是一段短肽，一种众所周知的抗体会紧紧结合它（例如FLAG、HA、Myc）。由于有现成的抗体识别它，你就能检测、定位或纯化任何戴着该标签的蛋白——当蛋白本身没有好抗体时尤其方便。亲和标签则是一种能结合特定基质的标签，让你只需把细胞提取液流过该基质即可纯化蛋白；标签黏住，其余一切被洗掉，再把纯蛋白洗脱下来。经典例子是His标签（六个组氨酸），它结合镍柱。一个标签常常同时担任两种角色。

标签是蛋白纯化和检测的日常工具。它让你能一步就从成千上万种蛋白里钓出某一种，用一种标准抗体在Western印迹上检测它，或捕获它的结合伙伴（pull-down实验）。代价与任何融合相同：标签是外来的额外质量，偶尔会干扰折叠、活性或定位，所以标签常被放在末端，有时事后还会用一种在内置位点切割的蛋白酶把它去掉。