计算与计算机模拟方法
类药性过滤
类药性过滤是一组简单的计算规则,用来剔除不太可能成为优良口服药物的分子,就像门口的保安在客人到门前就把明显不符合着装要求的人挡回去。把它用在庞大的化合物库上,便能快速而廉价地除去最没希望的候选物。
大多数过滤器会把易于计算的性质与源自已知药物的阈值相比较:分子量、亲脂性、氢键给体和受体的数目、极性表面积以及可旋转键。最著名的例子是用于口服吸收的利平斯基五规则。另一些过滤器则剔除含有反应性或干扰实验的子结构(如 PAINS 或结构警示)的分子,因为这类结构往往会导致误导性结果或毒性。
需要诚实说明的是:这些都是软性指引,而非定律。许多成功的药物违反了一条或多条规则,而像大环这样的整类药物形式更是有意置身于经典类药空间之外。过滤器最适合用于分流和排序,剔除明显有问题者,对仅仅不寻常者则加以标记而非禁止。若把它们当作硬性界限,可能会丢弃真正有希望的化学结构。
用于剔除 PAINS 或结构警示的过滤器,针对的是在实验中频繁产生假阳性或带有毒性风险的化合物,但被标记的基团只是提示需要进一步调查,并不自动等同于失败的证据。
又称
另见