苗头识别与筛选

泛检测干扰化合物

有些化合物在筛选界相当于那种对任何问题都说“好”的人——它们几乎对任何靶点、在几乎任何检测法中都表现为苗头,而这恰恰是你该不信任它们的原因。PAINS是“泛检测干扰化合物”的缩写,指那些臭名昭著的化学类别,它们产生误导性的阳性信号,并非靠真实而选择性的结合,而是靠麻烦的化学性质。

这些分子捣乱的方式各异:有的化学性质活泼,会不加选择地共价修饰蛋白;有的具氧化还原活性,生成活性氧;有的螯合金属、发荧光或聚集。共同点是滥交性——真正特异的药物只击中少数相关靶点,而PAINS则什么都击中,这正是假象而非机制的标志。

药物化学家使用已发表的子结构过滤器(如Baell–Holloway的PAINS警示)在化合物库和苗头清单中标出这些结构片段,以便审视或搁置。这个标记是警告,而非定罪:少数正当药物也含有类PAINS子结构,因此被标记的化合物应当用正交的、抗假象的检测法去测试,而不是自动丢弃。

对一份苗头清单做PAINS子结构过滤;几个被标记的儿茶酚和罗丹宁在不相关的反向筛选中也有响应后被降级处理。

子结构标记加上在多种检测法中的滥交表现,提示这很可能是PAINS假象。

PAINS过滤器是参考,而非铁律——它们既会过度标记,也会漏掉一些假象。可靠的判据是某苗头是否在多种正交检测法中表现得像真实、选择性的结合物,而不仅仅是它是否触发了某个子结构警示。

又称
pan-assay interference compoundsPAINS(泛检测干扰化合物)PAINS(泛檢測干擾化合物)