CRISPR 筛选

CRISPR 筛选一次向成千上万个基因提出同一个问题:“如果把你关掉,会有什么变化?”科学家不是编辑一个基因再观察结果,而是在庞大细胞群中给每个细胞编辑一个不同的基因,再看哪些编辑让细胞生长、死亡或表现不同。

在典型的混合筛选中,会递送一个向导 RNA 文库——常常对基因组中每个基因都设计一条或多条向导——使每个细胞只接收一条向导,从而敲除(或激活、或抑制)单个基因。随后把这些细胞置于选定的压力下,例如某种药物。通过在起始和结束时测序向导 RNA,统计哪些被富集或耗减,研究者便可推断哪些基因有助于或妨碍了存活。

筛选把遗传学变成一种大规模、系统化的搜索,已揭示出药物靶点、必需基因和耐药机制。它诚实的局限包括:编辑不完全或脱靶、各条向导效率参差不齐,以及需要谨慎的统计学——一个命中只是有待验证的假说,还不是已被证实的答案。