基因组组织与染色质

染色质的高级折叠

“串珠”只解决了把 DNA 装进细胞核的第一步。想象那串珠的线随后被盘绕成一根更粗的缆,缆又被绕成一道道钉在框架上的大弧,最后整团被紧紧卷起以便搬运。这种逐级递进的折叠——一层叠一层——正是染色质如何从一根细纤维变成一条致密染色体的过程。

从 10 纳米的“串珠”起步,相邻核小体(在组蛋白 H1 的帮助下)彼此靠拢,形成一种更粗的结构,经典上被描述为 30 纳米纤维。(这种规则纤维是否在活细胞内以稳定形式存在,确有争议;如今许多研究者设想的是一种更不规则、更动态的折叠,而非整齐的螺线管。)在此之上,纤维被组织成大环,环的根部锚定在蛋白质支架上,并锚定在挤出并固定这些环的黏连蛋白和凝缩蛋白环上。这些环和结构域继续进一步折叠,到细胞分裂时,凝缩蛋白把一切打包成致密盘绕的中期染色体——那个熟悉的 X 形——达成全部约一万倍的压缩。

高级折叠之所以重要,是因为它正是基因组在三维空间中既被存储、又被赋予功能的方式。环把 DNA 上相距遥远的片段拉到一起——例如,在线性序列上远在天边的一个增强子,可被折叠到它所控制的基因正旁边。这种成环还划定了调控元件发挥作用的“邻里”范围,并让染色体在分裂时凝缩以便干净地分开,同时又能在日常解开以供读取。简而言之,折叠不只是存储;它是基因如何找到自己控制开关的一部分。

压缩的阶梯大致是:裸 DNA -> 10 纳米串珠(缩短约 6 倍)-> 约 30 纳米纤维 -> 支架上的成环结构域 -> 凝缩的中期染色体(整体缩短约一万倍)。每一级都用长度换取秩序。

染色质一层叠一层地折叠,从串珠一直到中期染色体。

整齐的“30 纳米纤维”是教科书式的理想化。在活细胞内,染色质折叠看上去比均匀的螺旋更不规则、更动态,而更高层级究竟如何组织,至今仍在研究之中。

又称
30-nanometre fibrechromatin loopshigher-order packing30纳米纤维30奈米纖維