先導最佳化與藥物設計

骨架躍遷

骨架躍遷,是把分子的中心骨架整個替換掉,同時讓那些起作用的關鍵末端保持在原來的位置。想像一把椅子:只要坐面和靠背仍在人所需要的位置,你就可以把整個框架換成完全不同的設計。新分子外觀不同,卻做著同樣的工作。

骨架是把活性關鍵基團固定在恰當幾何位置上的核心環系或主鏈。在骨架躍遷中,化學家設計一個全新的核心,使那些關鍵基團擺放在等效的位置,卻在化學結構上與舊核心毫無關聯。藥效團得以保留,而連接它們的框架則被徹底更換。

化學家這麼做有非常現實的理由:繞開競爭對手的專利、修正舊核心中固有的代謝或毒性隱患,或改善溶解度和理化行為。其風險在於新骨架可能微妙地改變了幾何關係,因此紙面上看好的一次躍遷,實務中可能丟失活性,必須透過實驗加以確認。

對單個環的生物電子等排替換可視為一次小型骨架躍遷;大型躍遷則改變整個核心的拓撲結構。

又稱
scaffold replacement骨架替换骨架替換