合成驅動的構效關係

弄清一樣東西如何運作有兩種辦法：盯著它看，或者把它拆開再一塊塊重建。合成驅動的構效關係就是理解一個分子的動手方法：你實實在在地一個接一個地製備類似物，逐個測試，讓結果的規律告訴你哪些結構特徵至關重要。

實踐中，合成驅動的構效關係是一個迭代循環。假設提示出應當變換哪些位置；化學家合成一組針對這些位置的聚焦類似物；生物測定測量每個化合物；結果再去修正假設；如此循環往復。經過多輪，便能描繪出哪些特徵不可或缺、哪些可調、哪些純屬累贅，從而透過真實、經過測試的化合物——而非預測——逐步界定分子的結合需求。

這種以經驗為本、邊造邊測的策略，是醫藥化學歷史上的中流砥柱，至今不可或缺，尤其在沒有蛋白結構可指導設計時更是如此。它的代價恰恰也是它的長處：每一個資料點都需要真實的合成與測定時間，因此合成驅動的構效關係雖然強大，卻緩慢且耗費資源，這正是為何要在其旁輔以計算和基於結構的方法，來挑選哪些類似物值得製備。