構效關係
優勢結構
有些形狀似乎到哪兒都受歡迎,就像一個能插進許多插座的萬能轉接頭。優勢結構就是這樣一種分子骨架:在其上掛以不同的修飾之後,它能反覆地針對許多互不相關的藥物標靶產生出活性配體——彷彿這個內核本身就格外擅長與蛋白「各讓一步」地相遇。
這個術語由 Ben Evans 及其同事於 1988 年提出,用以描述諸如苯二氮平和聯苯這類骨架——它們在跨受體家族的配體中一次又一次地出現。通常的解釋是:這些內核提供了一種剛性、定義明確的芳香基團及其他基團的三維展示,恰好與許多結合口袋的常見特徵互補;而周圍的取代基則調控具體命中哪一個標靶。其他常被引用的例子還包括吲哚、苯並咪唑和螺哌啶骨架。
優勢結構是寶貴的起點,並在篩選庫設計中佔有重要地位,因為圍繞它們來構建會提高發現苗頭化合物的機率。誠實的告誡是:這種「優勢」是統計意義上的,而非神奇魔力——這些反覆出現的內核也往往易於濫交,可能帶來諸如脫靶活性或 hERG 隱患之類的包袱,而它們頻繁現身也部分反映了哪些化學反應易於實現。它們是一種先發優勢,而非選擇性或可開發性的保證。
苯二氮平骨架僅靠在同一稠環內核周圍變換取代基,便能產生針對 GABA-A 受體、膽囊收縮素受體以及其他若干互不相關標靶的配體。
同一個反覆出現的內核,命中眾多標靶——這正是優勢結構的標誌。
優勢結構是骨架層面的概念,而藥效團則是交互作用層面的概念。一個優勢骨架之所以常常奏效,正是因為它剛性的框架能夠清晰地呈現出若干藥效團特徵點。
又稱
另見