藥效團特徵點

可以把標靶對藥物真正的要求想成一張簡短的清單：這裡要伸一隻手抓住、那裡要有一個鉤子掛住、還要有一塊油膩的區域能貼合上去。藥效團特徵點就是這張清單上的一項——位於空間某一處的一個抽象特徵，分子必須提供它才能良好結合。

嚴格來說，藥效團特徵點是位於特定三維位置上的一類已定義的特徵，這類特徵包括氫鍵供體、氫鍵受體、可帶正電或負電的可離子化中心、芳香環或疏水基團等。若干這樣的特徵點按特定的距離和角度排布在一起，就構成一個藥效團——它是負責活性的抽象交互作用模式，與具體承載它的化學骨架無關。

藥效團特徵點之所以有用，正是因為它描述的是功能而非原子：兩個化學結構差異很大的分子，只要命中同一組特徵點，就能具有相似的活性。需要注意的是：藥效團本質上是從已知活性物推導出的假說；如果指認了錯誤的特徵點或設定了過多特徵點，所建模型就會檢索出偽陽性，並漏掉真正新穎的化學結構。