核苷酸切除修復（nucleotide excision repair）

有些DNA損傷對單字母小修匠來說太大、太扭曲：笨重的化學加合物、紫外線造成的使螺旋扭結的胸腺嘧啶二聚體，以及其他使雙螺旋形狀變形的損傷。核苷酸切除修復正是為這類笨重、使螺旋變形的損傷而設的途徑。鹼基切除修復擦掉一個字母，核苷酸切除修復則切掉一整個短語。

它的邏輯是識別變形本身，而非損傷的具體化學性質，這使一條途徑就能處理種類繁多的笨重損傷。蛋白質探測到螺旋上的扭結；隨後在受損鏈上、損傷兩側各切一刀，釋放出一段短的單鏈片段——在人類中約二三十個核苷酸長——把損傷一併帶走。接著修復聚合酶以完好的對側鏈為模板填補由此產生的缺口，連接酶封住最後的切口。笨重的損傷連同其周圍的一小段一起被切除，並以一份乾淨的拷貝取而代之。

核苷酸切除修復正是保護我們抵禦陽光的機制：它是人類細胞清除紫外誘發的胸腺嘧啶二聚體的主要途徑。著色性乾皮病把它的重要性暴露無遺，這種病由該途徑的遺傳缺陷引起，患者因陽光造成的二聚體始終無法清除，而遭受極度光敏感、嚴重皮膚損害以及高達千倍的皮膚癌風險。細菌用UvrABC蛋白運行著一個平行的版本，顯示出這套修復邏輯何其古老而不可或缺。