甲基掃描

如果你想找出一個分子身上怕癢的地方，你可以在許多位置上一處一處地輕輕戳它，看它在哪裡有反應。甲基掃描做的正是這件事：化學家製備一組類似物，每個都在不同位置上添加一個小小的甲基，然後測試，看甲基在哪裡有助、在哪裡有害、又在哪裡毫無影響。

具體而言，甲基掃描圍繞一個先導分子，逐個位置地系統引入一個 CH3 基團。甲基是一種最小化、化學上很簡單的探針：它在哪裡提升效力，通常就標示出口袋中有一處小的疏水空隙，或某種構象偏好被鎖定；它在哪裡令效力驟降，就提示存在空間衝突；它在哪裡毫無作用，則暗示那裡是開放空間或暴露於溶劑。每個結果都是相對於未取代母體的一個匹配分子對。

甲基掃描受重視，是因為甲基所增加的分子量和親脂性都很小，所以讀出的訊號相對乾淨。它的侷限在於覆蓋面：單一的小探針無法揭示更大的基團、極性基團或雜原子替換會帶來什麼，因此甲基掃描是一次先頭偵察，而非整場戰役。