真核生物的基因調控與表觀遺傳學

基因調控的層級(levels of gene control)

想像一本固定不變的食譜——基因組——它擺在廚房裡,從不改動。從這同一本固定的書出發,肝細胞的廚房做出膽汁蛋白和解毒酶,而神經元的廚房用著一份一模一樣的書的副本,卻做出離子通道和神經遞質機器。指令相同,產物卻天差地別。怎麼做到的?答案是:從基因到能幹活的蛋白質之間有許多環節,細胞可以在每一處插手,說要、不要、多一點、少一點、晚一點、或只在這裡不在那裡。

在真核細胞裡,從基因走到有活性的蛋白質是一條長長的流水線,每一個工位都能設一個控制點。首先,DNA可能被緊緊纏繞在染色質裡,機器連碰都碰不到;也可能被鬆開,讓機器搆得著——這是染色質層級的控制。接著,一個基因可能被轉錄成RNA,也可能不被轉錄,速率多快也是變量——轉錄層級的控制,是最大的槓桿。新生的RNA必須被加工——加帽、剪接、加尾——這裡的可變剪接還能讓一個基因造出不同的蛋白質。造好的信使RNA可以被運到細胞裡某個特定位置,可以被扣住,也可以被迅速銷毀——這是RNA穩定性和定位的控制。RNA可能被翻譯成蛋白質,也可能不被翻譯,翻譯有快有慢——翻譯層級的控制。最後,蛋白質本身還能被開啟或關閉、被標記銷毀、或被修飾——這是蛋白質活性的控制。細胞可以在任意一個層級出手,常常同時在好幾個層級一起出手。

這為什麼重要?因為它正是一個由單一基因組構成的身體能夠包含數百種不同細胞類型的原因,也是這些類型能各守其分的原因。細菌活得快、過得省,調控大多在轉錄起始處完成。真核生物要搭建精巧的多細胞身體,這身體必須能發育、能長久維持,於是它在每一個層級都疊上控制——這正是真核調控為何如此豐富。當你讀到轉錄因子、組蛋白密碼、微小RNA或DNA甲基化時,你讀到的都是這同一架梯子上的不同橫檔。

血紅蛋白的β-珠蛋白基因在皮膚細胞裡被關在緊密染色質中(染色質層級關閉),但在紅血球前體裡,染色質打開,轉錄因子結合,基因被大力轉錄,它的RNA被剪接、被穩定,翻譯全速運轉——每一個層級的控制都指向同一個方向。

一個基因,多道閘門:細胞可在DNA與蛋白質之間的任意階段出手。

真核生物比細菌調控得多,不是因為它們的基因「更好」——而是因為搭建和維持一個多細胞身體,需要穩定、精細、按細胞類型區分的控制。這些額外的層級是複雜性的代價,不是白送的升級。

又稱
stages of gene regulationtiers of expression control基因表达调控层次