苗頭辨識與篩選

DNA編碼化合物庫

想像一個巨大倉庫裡每件商品都帶有唯一條碼,於是你可以把所有東西倒進一個箱子,問「誰會黏在這個標靶上?」,再讀出勝出者的條碼,便能確切知道它們是什麼。DNA編碼化合物庫就是把這一思路用於化學:每個化合物都物理連接著一段短而唯一的DNA,像條碼一樣記錄它的合成歷史。

由於DNA標籤能標識分子,整個庫——常達數百萬到數十億種不同化合物——可以混在一起、在單個試管中一併篩選。把標靶(通常是純化蛋白)暴露於混合物中;結合的分子被捕獲,不結合的被洗去,存活者的DNA標籤經擴增後由定序讀出。出現頻率最高的條碼指向結合最好的化合物。

DEL以低成本提供數量驚人的化合物,但權衡是實實在在的:DNA標籤本身可能影響結合,苗頭必須脫去DNA重新合成(「脫DNA」再合成)以確認其真正有效,而讀出的是富集程度,而非乾淨的活性數值。和所有篩選一樣,DEL產出的是有待驗證的先導物,而非現成答案。

一個40億成員的DEL對固定化標靶進行淘選;定序揭示出幾個被富集的化學家族,將其脫DNA重新合成,確認為微莫耳級結合物。

DNA條碼讓數十億化合物在一個試管中篩選,並透過定序解碼。

DEL篩選報告的是哪些條碼被富集,而非化合物有多強。決定性的一步是脫去DNA標籤重新合成苗頭並測量真實活性。

又稱
DELDNA编码库(DEL)DNA編碼庫(DEL)