基因組組織與染色質
染色質的高級折疊
「串珠」只解決了把 DNA 裝進細胞核的第一步。想像那串珠的線隨後被盤繞成一根更粗的纜,纜又被繞成一道道釘在框架上的大弧,最後整團被緊緊捲起以便搬運。這種逐級遞進的折疊——一層疊一層——正是染色質如何從一根細纖維變成一條緻密染色體的過程。
從 10 奈米的「串珠」起步,相鄰核小體(在組蛋白 H1 的幫助下)彼此靠攏,形成一種更粗的結構,經典上被描述為 30 奈米纖維。(這種規則纖維是否在活細胞內以穩定形式存在,確有爭議;如今許多研究者設想的是一種更不規則、更動態的折疊,而非整齊的螺線管。)在此之上,纖維被組織成大環,環的根部錨定在蛋白質支架上,並錨定在擠出並固定這些環的黏連蛋白和凝縮蛋白環上。這些環和結構域繼續進一步折疊,到細胞分裂時,凝縮蛋白把一切打包成緻密盤繞的中期染色體——那個熟悉的 X 形——達成全部約一萬倍的壓縮。
高級折疊之所以重要,是因為它正是基因組在三維空間中既被存儲、又被賦予功能的方式。環把 DNA 上相距遙遠的片段拉到一起——例如,在線性序列上遠在天邊的一個增強子,可被折疊到它所控制的基因正旁邊。這種成環還劃定了調控元件發揮作用的「鄰里」範圍,並讓染色體在分裂時凝縮以便乾淨地分開,同時又能在日常解開以供讀取。簡而言之,折疊不只是存儲;它是基因如何找到自己控制開關的一部分。
壓縮的階梯大致是:裸 DNA -> 10 奈米串珠(縮短約 6 倍)-> 約 30 奈米纖維 -> 支架上的成環結構域 -> 凝縮的中期染色體(整體縮短約一萬倍)。每一級都用長度換取秩序。
染色質一層疊一層地折疊,從串珠一直到中期染色體。
整齊的「30 奈米纖維」是教科書式的理想化。在活細胞內,染色質折疊看上去比均勻的螺旋更不規則、更動態,而更高層級究竟如何組織,至今仍在研究之中。
又稱
另見