X 光繞射與結構解析

帕特森函數(Patterson function)

/ PAT-er-son /

帕特森函數是一張你即使缺了相位也能算出的「取巧地圖」,因為它刻意只用強度——也就是你真正量到的那樣東西。它不告訴你原子在哪裡,而是告訴你所有原子對之間的向量。帕特森圖裡的每個峰都在說:存在一對原子,相距這麼遠、朝這個方向。它是一張「相隔」而非「位置」的地圖。

其機制是一個食材選得很巧的傅立葉合成:P(u) = (1/V) 乘上對 hkl 的加總 |F(hkl)|^2 cos(2 pi (h u + k v + l w))。注意它用的是 |F|^2,這正是實驗直接給出的,而且完全不需要相位(相位實質上設為零)。每個峰出現在原子間向量 r_i 減 r_j 處,其權重正比於兩原子散射本領的乘積,約為 Z_i 乘 Z_j。於是重原子之間的向量高聳於其餘之上,讓你先找出重原子位置,再由此逐步帶出較輕的原子與它們的相位。

這是含少數重原子結構繞過相位問題的經典途徑(重原子法),至今仍是用來替蛋白質定相的同構取代之基礎。要誠實面對它的擁擠:對 N 顆原子有約 N 平方個原子間向量,所以帕特森圖遠比真實結構繁忙,峰彼此嚴重重疊。當少數重原子主宰時,解開它很直接;但當許多重量相近的原子都貢獻相當的向量時,就真的很難。

在一個由一顆重鉑原子與許多輕碳組成的分子裡,帕特森圖被 Pt 對 Pt 的向量主宰,其位置立刻透露鉑坐落何處——這就是替結構其餘部分定相的錨點。

它畫的是原子間的向量,不是原子;重原子向量最為主宰,提供起始的錨點。

帕特森峰是兩原子間的距離與方向,不是原子位置。因為有約 N 平方個向量,當許多相近原子都貢獻時,圖會擁擠到無從下手——它只在少數重原子突出時才發揮威力。

又称
Patterson mapPatterson synthesis帕特森圖帕特森合成