类转录激活因子效应物核酸酶（TALEN）

TALEN是第二代可编程DNA剪刀，它修正了锌指核酸酶最恼人的缺陷：靶向如今变得易于设计。它们的DNA读取部件借自一种叫TAL效应物的蛋白质，由黄单胞菌制造并注入植物，以开启植物基因。这类蛋白质的非凡之处在于它们读取DNA的方式何其简单。

一个TAL效应物由一串几乎相同的重复单元构成，每个重复恰好读取一个DNA碱基。某个重复读取哪个碱基，仅由它内部的两个氨基酸决定——这是一套简单的、近乎字母表式的密码：一对氨基酸表示「识别A」，另一对表示「识别C」，以此类推。要靶向任何序列，你只需把匹配的重复按顺序排好，就像逐字母拼出一个单词。TALEN把这个设计好的重复阵列拼接到锌指核酸酶所用的同一个FokI切割结构域上，同样成对工作、夹在目标两侧，使两个FokI半边相遇、造出一个双链断裂。

由于「一个重复读一个碱基」的密码如此清晰，TALEN比锌指核酸酶构建起来可靠且可预测得多，几乎能瞄准任何序列。它们今天仍因高度特异性、以及能靶向CRISPR难以处理之处而受重视。它们的缺点是体积庞大：每个TALEN都是一长串重复，组装和送入细胞都很笨拙。当CRISPR问世——只需订购一段短RNA即可重新编程，而非重新构建一整个蛋白质——它在日常应用中大体盖过了TALEN，尽管TALEN在许多场合仍是有力之选。