凡得瓦交互作用

即使是電中性的原子，靠得很近時也會感到一絲黏附。電子總在抖動，因此在任一瞬間，原子的電子雲都略微偏向一側，產生一個轉瞬即逝的微小電荷，誘使鄰近原子的電子雲也隨之偏移配合。這些短暫閃爍的吸引就是凡得瓦交互作用——單個幾乎可忽略，但當緊密接觸的眾多原子疊加起來，就匯成一股實實在在的握力。

其中的吸引部分稱為倫敦色散力，隨距離衰減得極為陡峭，因此只有當表面幾乎接觸時才起作用。但若靠得太近，這些原子的電子雲重疊，又會強烈排斥。這種近程吸引與陡峭排斥之間的平衡界定了原子的有效尺寸，也解釋了為何配體與口袋必須像手套配手一樣在形狀上吻合。

由於每個接觸都很弱，凡得瓦交互作用獎勵的是被埋藏的總表面積，而非任何單一點位。它們是形狀互補背後默默無聞的主力：一個平坦、沒有突出特徵的配體表面，只要與蛋白完美貼合，就能從無數微小接觸中獲得親和力，即便沒有任何明顯的氫鍵或電荷。