沉默子與絕緣子（silencer and insulator）

如果說增強子是把基因調高的開關，那麼細胞還需要另外兩種調控DNA：一種把基因調低，一種劃出邊界，免得某個開關串到錯誤的基因上。前者是沉默子；後者是絕緣子。想像一個吵鬧的派對——沉默子就像有人叫某位客人安靜下來，而絕緣子是那堵牆，擋住噪音溢進隔壁房間。

沉默子是增強子的鏡像：一段DNA，它結合抑制蛋白，這些蛋白隨即壓低或關閉附近的基因，常常是靠招募那些把染色質壓緊的酶，或是靠干擾轉錄機器的組裝。和增強子一樣，沉默子也能通過成環遠距離起作用。絕緣子則不同——它根本不把基因調高或調低；它設定邊界。它做兩件事：它能阻擋一個增強子去搆到位於它另一側的基因（這叫增強子阻斷型絕緣子，只有放在增強子與基因之間才有效），它也能充當一道屏障，攔住一波正在蔓延的、致沉默的緊密染色質爬進活躍區域。在脊椎動物裡，蛋白質CTCF結合許多絕緣子，並與一種叫黏連蛋白的環形複合物一起，把基因組組織成一個個成環的結構域。

這些元件合在一起，給了基因組標點符號。沒有絕緣子，一個強大的增強子會激活它搆得著的每一個基因，一片致沉默的染色質會一直蔓延，直到把近旁有用的基因捂死。絕緣子把染色體劃分成一個個街區——拓撲關聯結構域——在街區內部，增強子和它們的基因能彼此找到，跨越街區則大體上找不到。當一道絕緣子邊界被破壞，一個街區裡的增強子可能突然開啟一個它本不該觸碰的基因；這種「增強子劫持」是公認的一類癌症成因，生動地提醒我們：一個開關被允許搆到哪裡，和這個開關本身一樣受到調控。