西方墨點法（Western blot）

南方和北方墨點法檢測特定的DNA和RNA。但基因最終是以蛋白的形式發揮作用的，而你常常想知道某種特定蛋白是否存在於樣品中、又有多少。西方墨點法回答的正是這個——它是印漬家族中的蛋白成員，把DNA探針換成了抗體。

首先，細胞提取液中的蛋白在凝膠上按大小分離（SDS-PAGE用去垢劑包裹它們，使其純按大小遷移）。然後把它們轉移到膜上，保留原有的圖案。接著是蛋白特有的轉折：你不用互補的核酸探針，而用抗體——一種免疫蛋白，以極高的選擇性結合一種特定的靶蛋白（靠形狀而非鹼基配對來進行分子辨識）。一抗黏附到你感興趣的蛋白上；隨後一種攜帶酶或螢光標記的二抗結合一抗，放大信號。抗體結合到哪裡，那裡就出現一條帶。條帶的位置確認蛋白的大小，其強度反映存在多少蛋白。

西方墨點法是整個生物學和醫學中最常用的技術之一。它確認你選殖的基因是否真的被翻譯成了蛋白，檢驗某種蛋白在處理下變多還是變少，並檢測像磷酸化這樣的翻譯後變化（用專門辨識修飾形式的抗體）。它也是人們熟悉的一種診斷確認試驗——歷史上曾用於確認HIV抗體。它的局限在於特異性：結果的可信度不會超過抗體本身，而抗體可能結合到非靶蛋白上，給出誤導性的條帶。