類轉錄激活因子效應物核酸酶（TALEN）

TALEN是第二代可程式化DNA剪刀，它修正了鋅指核酸酶最惱人的缺陷：標靶如今變得易於設計。它們的DNA讀取部件借自一種叫TAL效應物的蛋白質，由黃單胞菌製造並注入植物，以開啟植物基因。這類蛋白質的非凡之處在於它們讀取DNA的方式何其簡單。

一個TAL效應物由一串幾乎相同的重複單元構成，每個重複恰好讀取一個DNA鹼基。某個重複讀取哪個鹼基，僅由它內部的兩個胺基酸決定——這是一套簡單的、近乎字母表式的密碼：一對胺基酸表示「辨識A」，另一對表示「辨識C」，以此類推。要標靶任何序列，你只需把匹配的重複按順序排好，就像逐字母拼出一個單詞。TALEN把這個設計好的重複陣列拼接到鋅指核酸酶所用的同一個FokI切割結構域上，同樣成對工作、夾在目標兩側，使兩個FokI半邊相遇、造出一個雙鏈斷裂。

由於「一個重複讀一個鹼基」的密碼如此清晰，TALEN比鋅指核酸酶構建起來可靠且可預測得多，幾乎能瞄準任何序列。它們今天仍因高度特異性、以及能標靶CRISPR難以處理之處而受重視。它們的缺點是體積龐大：每個TALEN都是一長串重複，組裝和送入細胞都很笨拙。當CRISPR問世——只需訂購一段短RNA即可重新程式化，而非重新構建一整個蛋白質——它在日常應用中大體蓋過了TALEN，儘管TALEN在許多場合仍是有力之選。