蛋白質結構與功能
鎖鑰模型與誘導契合
酶是如何從細胞那擁擠的「湯」裡恰好抓住對的分子,並把它握得穩穩當當來做化學的?人們提出過兩種圖景,而它們之間的對比,能告訴你許多關於蛋白質真實行為的事。
較早的圖景是鎖鑰模型,由埃米爾·費舍爾(Emil Fischer)於 1894 年提出。它說酶的活性位點是一個剛性的形狀,而底物是一把恰好與之相配的鑰匙;只有對的鑰匙才能插進那把鎖,這乾淨俐落地解釋了專一性。較新、更準確的圖景是誘導契合,由丹尼爾·科什蘭(Daniel Koshland)於 1958 年提出。它說活性位點並非剛性,而是有些柔性:當對的底物靠近時,酶實際上會改變形狀,環抱住底物,就像手掌包住一個球,或手套隨著手滑入而塑形。結合與形狀改變是一同發生的。這種緊密的合攏不僅握住底物,還幫助把催化側鏈對齊,並把底物拉向它的過渡態。
這一區別為什麼重要?鎖鑰模型是一幅不錯的初步速寫,作為專一性的簡便說法至今仍有用,但誘導契合更貼近現實,能解釋鎖鑰所不能解釋的事:為什麼有些酶只有在底物到來後才變得有活性,以及在一處的結合如何能重塑另一處。在你自己的思考裡要對此誠實:剛性鑰匙的模型是一種近似;真實的蛋白質是柔性的、會「呼吸」的機器,而這種柔性正是它們工作方式的一部分。
己醣激酶是給葡萄糖打上磷酸標記的酶,它會明顯地環抱住葡萄糖、合攏閉口,就像吃豆人合上嘴巴——這是誘導契合的教科書畫面,剛性的鎖鑰模型永遠捕捉不到。
真實的酶常會環抱住底物——這是剛性鎖鑰圖景所忽略的柔性。
鎖鑰是較簡單、較早的模型;誘導契合是較準確的模型。鎖鑰與其說「錯」,不如說不完整——它忽略了蛋白質真實的柔性。
又稱
另見